A történet ott folytatódik, ahol az első évad csak hónapokkal a jövőben zárult le. Javították Yuokai Gakuent, és folyamatban van az új félév. Tsukune és a banda visszatért, és hatalmasabb, mint valaha. Az Anti-Thesis valódi identitása megkönnyebbül. Az új ellenfelekkel a láthatáron, és valami sokkal baljósabb dologgal, mint amivel a banda valaha is szembesült.
Tsukune harcol a benne lévő szörnyeteggel. Moka, Mizore, Kurumu, Ruby és Yukari segítségével. Tsukune kiképezi, hogy ellenőrzése alatt tartsa vámpírvérét, és megőrizze erőt azért, amit kedvesének tart.
Az új évad inkább a lányokra, a múltjukra és a családjukra összpontosít. Új konfrontációk várnak rájuk. Új barátok és szövetségesek csatlakoznak hozzájuk. Együtt fedezik fel Moka rózsafüzér titkait és származását…
